De klachten van een prostaatontsteking zijn niet altijd merkbaar. Het is goed mogelijk dat iemand al een tijd een prostaatontsteking heeft maar het nooit gemerkt heeft. De pijn dat wordt veroorzaakt door een prostaatontsteking kan op verschillende plekken plaats vinden; in de onderbuik, kruis, rug en liezen. Het is doorgaans geen scherpe pijn maar meer een zeurende pijn. Klachten zoals branden bij het plassen, vaker passen en de plas niet kunnen ophouden komen vaker voor bij een prostaatontsteking.